Karl, 18, heeft eerder gesproken over zijn bewondering voor de Spaanse grootmachten en wordt vertegenwoordigd door Ballack, die tijdens zijn carrière voor Bayern speelde.
Sprekend op de Kerners11 podcast, zei Ballack dat de opmerkingen van de tiener uit hun context waren gehaald.
"Ze vroegen hem: 'Wat is je favoriete club naast FC Bayern?' Dat deel wordt vaak weggelaten. Er was eigenlijk niets mis met wat hij zei."
Ballack legde uit dat Karl simpelweg sprak over een ambitie die hij later in zijn carrière zou willen vervullen.
"Hij sprak gewoon over een droom die hij misschien op een dag zou willen vervullen door voor Real Madrid te spelen. Ik had dat ook altijd in mijn achterhoofd," zei Ballack met een lach.
Karl blijft een speler van Bayern München en wordt beschouwd als een van de veelbelovende jonge talenten van de club, maar zijn opmerkingen hebben onvermijdelijk speculaties over zijn langetermijnambities aangewakkerd.
Ballack's uitleg suggereert dat de opmerkingen over Real Madrid gingen over een persoonlijke droom in plaats van een indicatie dat Karl actief op zoek is naar een vertrek uit München.