Johan Manzambi opende de score op zijn 21e verjaardag voordat Nicolas Jackson twee keer scoorde om Villa stevig in controle te brengen bij de rust. Ross Barkley voegde een tweede helft brace toe, en Tammy Abraham voltooide de afgang in de 90e minuut.
Emery was verheugd om een andere memorabele Europese gelegenheid te delen met het publiek in Villa Park, terwijl hij benadrukte dat zijn team nog verbeteringen moet aanbrengen.
"Fantastische avond, fantastisch," zei hij. "De Champions League is de competitie waarin we ons comfortabel kunnen voelen en concurreren in de richting die we vandaag hebben gedaan, de richting die we deden in de eerste wedstrijd tegen Brugge.
"Natuurlijk is het heel moeilijk. We zijn geen kandidaten om deze trofee te winnen. Er zijn veel teams, zeer belangrijke teams en zeer krachtige teams die kandidaten zijn en favorieten om deze competitie te winnen.
"Maar twee jaar geleden bereikten we de kwartfinales door onze consistentie, door onze ambities, door onze eisen, en hoe we dit seizoen in deze competitie zijn begonnen is echt fantastisch."
De prestatie van Villa bood ook aanmoediging voor Emery terwijl zomeraankopen en terugkerende spelers zich bleven aanpassen aan zijn structuur.
"Grote bijdragen van die spelers, maar ook, enkele veranderingen. We moeten spelers toevoegen die concurreren, fit worden, zich comfortabel voelen in onze structuur," zei hij.
"Sommigen, ze worden geleidelijk beter en tonen het zoals Mbaye, zoals Manzambi - natuurlijk, na zijn blessure, voelt hij zich geleidelijk comfortabel, vandaag scoorde hij één doelpunt.
"Nicolas Jackson, ook, hij voelt zich steeds beter. Maar we hebben meer spelers nodig."
Fenerbahçe-coach İsmail Kartal was ontevreden over de manier van de nederlaag, vooral de fouten die Villa in staat stelden om controle te nemen.
"De eerste en tweede helft verdienden dit resultaat niet. Maar je concurreert op het hoogste niveau. Je zou zulke simpele passingfouten niet moeten maken. Mijn spelers en ik hebben zeer belangrijke lessen geleerd. Dit is geen acceptabele score," zei Kartal.
Hij vond dat zijn ploeg competitief bleef tot de penalty die het 4-0 maakte, waarna de wedstrijd weggleed.
"Het team reageerde goed tot de 62e minuut. Na de penalty viel de wedstrijd uit elkaar door fouten die we maakten. We moeten dit vergeten. We hebben nog veel wedstrijden te spelen in de Champions League. We willen Alanyaspor over drie dagen verslaan en onze fans helpen deze nederlaag te vergeten."
Voor Emery gaat de aandacht snel uit naar het bezoek aan Newcastle United op zaterdag.
"Hopelijk, die verbeteringen die we vandaag hebben bereikt, en ook hoe we vooruitgang boeken, beter worden maar niet genoeg zijn, hopelijk zullen we dat opnieuw bereiken op zaterdag tegen Newcastle," zei hij.