Nicolas Pépé deu aos anfitriões uma vantagem precoce antes de Luismi Cruz empatar com uma assistência de Aubameyang, e um gol contra de Adama Traoré restaurou a vantagem do Villarreal antes de Zakaria Eddahchouri igualar novamente, também assistido por Aubameyang, antes do próprio gol da vitória tardia do atacante gabonense.
O resultado deixa a equipe de Íñigo Pérez ainda sem vitórias em quatro jogos da liga antes da viagem à Liga dos Campeões contra o Borussia Dortmund, enquanto o Deportivo promovido permanece invicto.
Pérez foi relutante em se esconder atrás da arbitragem ou erros individuais ao avaliar a derrota.
"Eu concordo. Mas além dos erros que podem acontecer no futebol, temos que olhar e corrigir outras coisas, porque mesmo sem cometer esses erros e encontrar uma vitória, a sensação teria sido semelhante," disse ele. "Acho que estamos perdendo algo que, como treinador, estou procurando e talvez não tenha encontrado."
O chefe do Villarreal deixou claro que o mau começo do clube precisa de atenção urgente antes da abertura da Liga dos Campeões na quarta-feira.
"O jogador é capaz de recuperar a confiança em dois dias, sabendo que já fez isso muitas vezes antes, que teve sucesso, que cria oportunidades, que pode vencer em Dortmund," disse ele.
"Isso não me preocupa e eu sei que eles estarão prontos, mas este começo de temporada nos dá alguns sintomas, alguns sinais de alerta, que precisamos abordar urgentemente para que não se repitam."
Pérez encontrou um ponto positivo a ser tirado da tarde na performance de uma nova contratação.
"Um dos aspectos positivos foi a emergência de Nathan. Acho que ele teve um jogo muito importante. Com pouco tempo em campo, ele mostrou energia, mostrou qualidade, e acho que isso é algo para se agarrar," disse ele, referindo-se à contratação de verão Nathan Saliba.
Antonio Hidalgo, por sua vez, ficou emocionado ao ver sua equipe recém-promovida do Deportivo conquistar um resultado prestigioso.
"Este é um caminho muito longo, falta menos para a sobrevivência, mas ainda são necessários muitos pontos para o objetivo do clube, que é permanecer na divisão," disse o chefe do Deportivo. "Conseguimos uma vitória brutal contra um grande time."
Hidalgo elogiou a coragem de seus jogadores após estar duas vezes atrás no placar.
"No final, os rivais na primeira divisão exigem muito de você, você tem que ser corajoso, e temos coragem e um poder de finalização, e isso é uma grande virtude," disse ele, antes de se voltar para seu atacante estrela.
"Você tem que ver como ele treina e o sorriso que ele espalha para todos. Tenho a sorte de ter jogadores famintos e de alta qualidade -- temos que continuar trabalhando duro e lutar por três pontos contra o Getafe a seguir."