De Saints werden verwijderd uit de play-off finale van zaterdag tegen Hull City nadat ze hadden toegegeven te hebben gespioneerd op de training van Middlesbrough, Ipswich Town en Oxford United.
Middlesbrough, dat met 2-1 in het totaal verloor van Southampton in de halve finale, is nu hersteld in afwachting van een beroepshoorzetting.
Clubanalist Will Salt zou zijn betrapt terwijl hij de training van Middlesbrough filmde vanuit achter een boom, voordat hij later zijn pinpas gebruikte in een nabijgelegen golfclub café.
Le Tissier gelooft dat de straf veel zwaarder weegt dan de overtreding.
"Het voelt alsof je voor moord terechtstaat terwijl je alleen maar een Mars-reep uit de buurtwinkel hebt gestolen," vertelde Le Tissier The Sun.
"Dat is een beetje hoe het voor mij voelt."
De voormalige Southampton-aanvaller betoogde dat duiken voor penalties een grotere directe impact heeft op voetbalwedstrijden dan het verzamelen van informatie over de training van de tegenstander.
"Wanneer je niet door een tegenstander bent aangeraakt en je gaat in de zestien naar beneden, is dat overduidelijk vals spelen," zei hij.
"En dat is iets dat veel meer impact zal hebben op een wedstrijd."
Het verwijderen van Southampton uit de play-offs zal de club de toegang tot de Premier League kosten, waarbij de promotie naar schatting ongeveer £215 miljoen waard is.
Le Tissier suggereerde dat de straf effectief neerkomt op een financiële boete van ongeveer £100 miljoen gezien de kans van de club om promotie te winnen.
De Saints waren de play-offs binnengekomen met een ongeslagen reeks van 21 wedstrijden onder manager Tonda Eckert voordat het schandaal aan het licht kwam.
Le Tissier vroeg zich ook af of de EFL de bredere gevolgen van zijn uitspraak volledig had overwogen, met verstoorde voorbereidingen voor Hull en Wrexham die naar verluidt juridische wegen onderzochten als de uitsluiting van Southampton standhoudt.
"Ik weet niet zeker of ze alle gevolgen hebben doordacht," zei hij.
"Het gaat rommelig worden."
De voormalige Engelse international reserveerde bijzondere sympathie voor de supporters en spelers van Southampton, van wie velen nu het risico lopen een kans op de Premier League te verliezen door omstandigheden buiten hun controle.