De aankondiging komt nadat de voormalige Spaanse international de afgelopen weken in New York heeft doorgebracht als analist voor de WK-uitzendingen van ITV, waar hij wedstrijden heeft geanalyseerd samen met Gary Neville, Patrick Vieira en Ange Postecoglou.
De voormalige middenvelder van Manchester United en Chelsea, Mata, heeft ook gekeken hoe Australië voor het eerst in de geschiedenis de knockout-fases van het WK bereikt, wat zijn geloof in de groei van het Australische voetbal verder versterkt, nadat hij tijdens het afgelopen seizoen tot Speler van het Jaar in de A-League werd benoemd.
Melbourne Victory bevestigde dat de investering volledig gescheiden is van Mata's contract als speler en deel uitmaakt van een langetermijnvisie die door beide partijen wordt gedeeld.
Zodra hij met professioneel voetbal stopt, zal Mata een institutionele rol bij de club op zich nemen en een nieuw opgerichte voetbalcommissie voorzitten.
"Ik geloof sterk in de toekomst van het Australische voetbal. Vanaf de eerste dag voelde ik de passie rondom deze club en het enorme potentieel van de A-League.
"Ik wil deel uitmaken van wat er daarna komt, niet alleen voor één seizoen, maar voor de lange termijn."
De investering maakt Mata een van de weinige actieve internationale voetballers die een eigendomsbelang verwerft in de club die hij momenteel vertegenwoordigt.
"Ik heb elk moment op het veld het afgelopen jaar genoten, dus me verbinden aan Victory als aandeelhouder is de natuurlijke volgende stap in mijn reis."
Voorzitter John Dovaston van Victory beschreef de overeenkomst als een mijlpaal voor zowel de club als het nationale spel.
"Voor een voetballer van Juan's kaliber om te investeren in Melbourne Victory is een historisch moment voor ons en voor het voetbal in dit land.
"Juan is een investeerder met uitstekende oordelen die al belangen heeft in elite sportorganisaties over de hele wereld."
Chief executive Caroline Carnegie verwelkomde ook de overeenkomst en benadrukte de bredere waarde die Mata zal brengen, naast zijn prestaties op het veld.
"Juan brengt de intelligentie van een atleet van wereldklasse, de mindset van een investeerder en een duidelijke langetermijnverbintenis."
De financiële details van de investering zijn niet bekendgemaakt, hoewel de club bevestigde dat de deal Mata een aanzienlijk langetermijn minderheidsbelang geeft en zijn vertrouwen in de strategische richting van Melbourne Victory weerspiegelt.