Yasser Ibrahim's kopbal in de eerste helft bracht Egypte op voorsprong, en Lionel Messi zag vervolgens een penalty gestopt door Mohamed El Shenawy aan beide kanten van de pauze.
Mostafa Zico verdubbelde de voorsprong van Egypte in de 67e minuut nadat een VAR-herziening eerder een poging had afgekeurd wegens een fout op Lisandro Martinez. Argentinië leek verslagen, totdat Cristian Romero in de 79e minuut met een kopbal uit een voorzet van Messi gelijkmaakte, voordat Messi zelf vier minuten later scoorde om gelijk te maken. Enzo Fernandez voltooide de ommekeer diep in de blessuretijd door de winnende goal te maken en de titelverdediger Argentinië door te sturen naar de kwartfinale tegen Zwitserland.
Hoofdcoach Lionel Scaloni was na afloop overweldigd door emoties en onderbrak zijn interview aan de zijlijn: "Ik kan niet omhoog kijken, het spijt me. Ik ben echt emotioneel op dit moment. Wat een groep spelers. Dat is het, ik moet gaan."
Fernandez, wiens doelpunt in de blessuretijd de wedstrijd besliste, reflecteerde op de jaren van achtervolging die aan dit moment voorafgingen.
"Ik verlangde al ongeveer drie jaar naar dat doelpunt, sinds het WK in Qatar. Het kunnen ervaren van momenten als deze, eerlijk gezegd, dank ik God, ik ben bevoorrecht.
"En ik wil mijn teamgenoten benadrukken - we hebben een fenomenale groep, een groep die nooit opgeeft, ongeacht de moeilijkheden en tegenslagen. We zijn altijd samen. Dank aan mijn teamgenoten, aan de coachingstaff, en aan iedereen die ons hier aanmoedigt en aan alle Argentijnen thuis in Argentinië. Nog een stap vooruit."
Egypte-baas Hossam Hassan was verwoest door de manier van verliezen en benadrukte dat zijn team aan de verkeerde kant van factoren buiten het veld stond.
"We waren beter, maar voetbal is oneerlijk," zei hij. "Het kan een kwestie van marketing zijn, ze willen misschien een WK maken met de kampioen van het laatste WK, ze willen dat Messi bestaat (in het toernooi). Ik dank mijn spelers zeer. Aan alle Egyptenaren, de Arabieren, de Afrikanen, jullie kunnen hard werken, dat is wat je moet doen, maar soms zijn er andere factoren die je laten worstelen.
"Ik wou dat we gelukkiger konden zijn met het verlies, maar met een zware nederlaag zoals vandaag zeg ik tegen hen (mijn spelers) dat ze zich verdrietig moeten voelen. We wensen dat we gelukkiger konden zijn. Dank God voor alles, maar voetbal is anders dan wat er in het stadion gebeurt wanneer we tegen de wereldkampioenen spelen. Er is steun vanuit alle hoeken voor de wereldkampioenen. Steun en marketing."
Hassan voegde later toe: "Waarom is er geen eerlijkheid in de sport? In het voetbal? Ik wil het hier niet mooi proberen te verwoorden. We zijn vandaag oneerlijk behandeld. We hebben onrecht geleden."
Doelpuntenmaker Zico ging verder en wees de Franse scheidsrechter Francois Letexier aan terwijl hij zijn tranen bedwong.
"Scheidsrechter, niet eerlijk. Onrechtvaardig, onrechtvaardige scheidsrechter. Een onrechtvaardig persoon. Een onrecht dat zo duidelijk is. Hij verspilt de inspanning van een hele natie. Sinds het begin van de wedstrijd stonden we 2-0 voor tegen Argentinië. Maar de beker is al uitgereikt."
Hij bood ook een bittere felicitatie aan Argentinië: "Ik bied mijn excuses aan (de Egyptische fans). We wilden ze vandaag gelukkig maken. We wisten niet hoe we dat moesten doen. Maar, bij God, het ligt niet in onze handen; het ligt in de handen van de scheidsrechter. De beker is al beslist. Gefeliciteerd aan Argentinië met het WK. Gefeliciteerd. Je hebt niets anders nodig."
Argentinië richt nu hun aandacht op Zwitserland in de kwartfinales, terwijl Egypte vertrekt na voor het eerst in hun geschiedenis de knockout-fases van het WK te hebben bereikt.