El equipo de Quique Sánchez Flores golpeó al contraataque poco antes de la media hora, Antonio Blanco cambiando el juego a Ángel Pérez, quien asistió a Boyé para que anotara.
Resultó ser el único gol, con Alavés sobreviviendo a un final emocionante - incluyendo un pasaje de juego que vio el balón regresar de tres postes diferentes - para sellar un tercer inicio invicto consecutivo y ascender a la cima de la tabla.
Sánchez Flores estaba encantado con la intensidad de su equipo contra un Villarreal que valora mucho.
"Desde el primer momento fue un partido muy intenso. Vencimos a un equipo realmente bueno con una calidad individual extraordinaria - es muy difícil quitarles el balón. Fuimos muy intensos, y dondequiera que estaba el balón, teníamos muchas piernas allí," dijo.
"Es fantástico y maravilloso. Es un inicio histórico después de mucho tiempo. Eso significa que los aficionados, por quienes jugamos, tienen algo que no han sentido en años."
También elogió sus opciones en el mediocampo: "La gran mayoría de los partidos se deciden por lo que sucede en el centro del campo, y estamos muy bien allí. Hoy jugaron Protesoni, Denis, Antonio, Mikel y Pablo."
Sánchez Flores elogió la actuación combativa de Boyé, a pesar de que el delantero fue sustituido por un problema en el aductor que se manejó cuidadosamente durante el partido.
"Lucas fue sensacional. Ha estado lidiando con una lesión en la ingle y hemos tenido que gestionar sus minutos con cuidado. Hoy tuvo que jugar más de lo planeado, pero juega partidos muy difíciles porque recibe muchas faltas," dijo el entrenador.
Para el entrenador del Villarreal, Iñigo Pérez, que aún espera su primera victoria al mando, fue una derrota dolorosa.
"Cualquier derrota es dolorosa. Estábamos en una curva ascendente, con ideas que comenzaban a afianzarse. Hoy, por períodos, estábamos llegando - creamos oportunidades y no las aprovechamos. Pero el enfoque no debería estar en lo que se está asentando, debería estar en lo que nos está costando," dijo.
Señaló una tendencia a desconectarse defensivamente cuando sus nuevas ideas están funcionando bien en posesión: "Cuando las cosas van bien, puedes enamorarte de ello, y cuando necesitas volver a defender, hay un poco de letargo. Nos pasó en Santander, el Metropolitano fue un partido diferente. Necesitamos defender ciertas situaciones mejor."
Pérez utilizó un momento en que el balón golpeó el travesaño tres veces en rápida sucesión como una metáfora para el inicio de temporada de su equipo.
"No había visto un triple poste antes. Pensé que iba a entrar. Es un buen ejemplo de lo que nos está pasando. Lo merecemos, estamos jugando bien, y la actitud es buena," dijo. "El proceso va bien, estoy contento con el trabajo, solo no con los puntos que tenemos," añadió, insistiendo en que nunca teme por su trabajo y que su responsabilidad con el club es más profunda que cualquier preocupación por los resultados.