Junior Kroupi brachte die Gäste nach 16 Minuten in Führung, bevor Gyokeres vom Elfmeterpunkt aus ausglich, nachdem Ryan Christie im Strafraum handspielte.
Alex Scott erzielte dann den Siegtreffer, als noch 15 Minuten zu spielen waren, wodurch Arsenals Titelvorsprung auf neun Punkte schrumpfte - während Manchester City zwei Nachholspiele hat und nächstes Wochenende noch zum Etihad reisen muss.
In einem Gespräch mit Match of the Daysagte Gyokeres: "Wir hatten am Ende einige okay Chancen. Der Platz war vielleicht ein bisschen trocken, um ehrlich zu sein, das hat nicht geholfen, aber natürlich, wie ich schon sagte, müssen wir alle besser werden und unsere Chancen nutzen."
Der Kommentar verbreitete sich schnell online, wobei Fans darauf hinwiesen, dass das Emirates Arsenals eigenes Heimstadion ist. Einer schrieb: "Der Platz war ein bisschen trocken, sagte er... Bruder erinnert sich nicht, dass es tatsächlich ihr eigenes Heim ist." Ein anderer bemerkte, dass der Platz zur Halbzeit bewässert worden war.
Gyokeres sprach auch mit TNT Sportsund bot eine umfassendere Sicht darauf, wo Arsenal schwach war.
"Ich denke, wir hätten in beiden Halbzeiten viel besser spielen können. Wir haben das Spiel nicht gut genug kontrolliert. Und sie sind ein gutes Team, also wenn sie einige Chancen bekommen, wird es schwierig für uns und wir mussten dort besser sein und dann natürlich offensiv mehr tun."
Auf die Frage, ob Arsenal zerfahren war, war er offen.
"Ja, ich denke, wir hatten vor dem Spiel ein gutes Gefühl und während des Spiels waren wir für alles bereit, aber sie haben es uns schwer gemacht und wir haben es uns selbst schwer gemacht und deshalb ist das Endergebnis so, wie es ist. Es tut immer weh, wenn man verliert."
Trotz des Ergebnisses - Arsenals dritter Niederlage in vier Spielen - bestand Gyokeres darauf, dass der Kader volles Vertrauen behielt.
"Wir haben noch viele Spiele zu spielen und wir wissen, wie gut wir sind - wir müssen es nur auf dem Platz zeigen. Wir müssen wieder in diesen Rhythmus zurückfinden, in dem wir spielen können, und an uns selbst glauben."
"Sehr zuversichtlich," fügte er hinzu, als er gedrängt wurde. "Ich denke, wir dürfen uns nicht zu sehr auf das konzentrieren, was heute passiert ist. Wir müssen nach vorne schauen, positiv denken und uns auf die Spiele freuen."
Arsenal trifft am Mittwoch im Rückspiel des Champions-League-Viertelfinales auf Sporting und hat eine 1:0-Führung. Dann kommt City ins Etihad. Die nächsten sieben Tage werden entscheidend dafür sein, ob dieses Titelrennen noch eine Wendung hat.