Os Saints foram removidos da final dos playoffs de sábado contra o Hull City após admitirem ter espionado os treinos de Middlesbrough, Ipswich Town e Oxford United.
O Middlesbrough, que perdeu por 2-1 no agregado para o Southampton nas semifinais, foi reintegrado enquanto aguarda uma audiência de apelação.
O analista do clube, Will Salt, foi supostamente flagrado filmando o treino do Middlesbrough de trás de uma árvore antes de usar seu cartão de débito em um café de um clube de golfe nas proximidades.
Le Tissier acredita que a punição supera em muito a ofensa.
"Parece que você foi colocado em julgamento por assassinato quando tudo o que fez foi roubar uma barra de Mars da loja de esquina," disse Le Tissier. O Sol.
"É mais ou menos assim que me sinto."
O ex-atacante do Southampton argumentou que simular faltas para pênaltis tem um impacto direto maior nos jogos de futebol do que coletar informações sobre os treinos do adversário.
"Quando você não foi tocado por um adversário e cai na área, isso é uma trapaça flagrante," ele disse.
"E isso é algo que terá muito mais impacto em uma partida."
A remoção do Southampton dos playoffs custará ao clube o acesso à Premier League, com a promoção estimada em cerca de £215 milhões.
Le Tissier sugeriu que a punição equivale efetivamente a uma penalidade financeira de cerca de £100 milhões, dada a chance do clube de conquistar a promoção.
Os Saints haviam entrado nos playoffs em uma sequência de 21 jogos sem perder sob o comando do treinador Tonda Eckert antes que o escândalo emergisse.
Le Tissier também questionou se a EFL considerou totalmente as consequências mais amplas de sua decisão, com os preparativos do Hull sendo interrompidos e o Wrexham supostamente explorando vias legais caso a expulsão do Southampton se mantenha.
"Não tenho certeza se eles pensaram em todas as ramificações," ele disse.
"Vai ser complicado."
O ex-internacional inglês reservou particular simpatia pelos torcedores e jogadores do Southampton, muitos dos quais agora enfrentam a perda de uma oportunidade na Premier League devido a circunstâncias fora de seu controle.