O atacante foi forçado a sair no primeiro tempo do empate de 2-2 da Liga das Nações na noite de quinta-feira em Amsterdã após sofrer um desafio de Quinten Timber.
O treinador da Alemanha, Jürgen Klopp, disse após a partida que Havertz provavelmente não deverá atuar novamente durante a atual pausa internacional.
"Provavelmente fora para nós, mas espero que então também esteja relativamente disponível novamente rapidamente," disse Klopp.
A Associação Alemã de Futebol descreveu o problema de Havertz como uma distensão muscular, com o jogador de 27 anos agora deixando o acampamento da seleção nacional para retornar ao seu clube.
Testes adicionais determinarão a extensão da lesão, com o Arsenal esperançoso de que Havertz tenha evitado uma ausência significativa.
O tempo dá ao atacante algum tempo de recuperação, com o Arsenal não jogando novamente até receber o Leeds no Estádio Emirates em 10 de outubro.
Havertz teve um início forte na temporada após superar problemas de lesão que o restringiram na última temporada. Ele marcou na vitória do Arsenal na Supercopa da Comunidade sobre o Manchester City e havia começado todas as cinco partidas da Premier League.
Ele já igualou sua contagem de gols na liga de toda a última temporada, marcando duas vezes nas semanas iniciais da campanha.
O Arsenal agora aguardará os resultados dos exames adicionais antes de determinar por quanto tempo Havertz poderá ficar indisponível.
Os problemas anteriores de lesão na coxa do atacante incluíam uma lesão sofrida durante um acampamento de treinamento no meio da temporada em Dubai, que o manteve fora por uma parte significativa da campanha 2024/25.