De 58-jarige volgt Antonio Conte op, die de Serie A-club aan het einde van mei verliet na twee seizoenen aan het roer.
Conte leidde Napoli naar de Serie A-titel van 2024-25 voordat de club vorig seizoen als tweede eindigde, een slip die uiteindelijk zijn positie kostte.
Allegri keert terug naar Napoli, waar hij eerder het clubshirt droeg als speler tijdens een korte periode in het seizoen 1997-98.
Hij arriveert transfervrij nadat hij aan het einde van het vorige seizoen door AC Milan was ontslagen, en Napoli had gewacht op de beëindiging van zijn Milan-contract voordat de transfer werd afgerond.
De beslissing van Milan om met Allegri te breken volgde op het feit dat de club de Champions League-kwalificatie misliep, met een vijfde plaats na slechts twee van hun laatste acht competitiewedstrijden te hebben gewonnen.
Zijn vertrek maakte deel uit van een bredere herstructurering bij de club in San Siro, waarbij ook sportief directeur Igli Tare, technisch directeur Geoffrey Moncada en CEO Giorgio Furlani hun posities verlieten.
Allegri wordt beschouwd als een van de meest succesvolle coaches in het Italiaanse voetbal.
Hij won de Serie A-titel met Milan in 2011 voordat hij een enorm succesvolle eerste periode bij Juventus beleefde.
Tussen 2014 en 2019 leidde hij de Turijnse club naar vijf opeenvolgende Serie A-titels, vier opeenvolgende Coppa Italia-overwinningen en twee Italiaanse Supercups.
Juventus bereikte ook twee keer de finale van de Champions League onder Allegri tijdens die periode, in 2015 en 2017.
Hij keerde in 2021 terug naar Juventus en tilde in 2024 een vijfde Coppa Italia omhoog, voordat hij tijdens het seizoen 2025-26 voor de tweede keer de leiding over Milan nam.
Gedurende zijn trainerscarrière heeft Allegri zes Serie A-titels, vijf Coppa Italia-trofeeën en drie Italiaanse Supercups gewonnen.
Hij is twee keer uitgeroepen tot Serie A Coach of the Year, een weerspiegeling van de consistentie die hij heeft getoond gedurende twee decennia in het Italiaanse voetbalmanagement.
Napoli zal nu op Allegri rekenen om te herbouwen na het missen van de titel vorig seizoen, meer dan 25 jaar nadat hij voor het eerst het clubshirt als speler droeg.
Hij wordt de nieuwste hooggeplaatste aanstelling in een Serie A-trainerscarrousel die ook heeft gezien dat Milan hun hele voetbaloperatiestructuur heeft herzien, met Tare, Moncada en Furlani die deze zomer allemaal vertrokken.