Karl, 18, bracht de Duitse kampioenen vlak voor de rust op voorsprong en vierde door zijn vinger naar zijn lippen te brengen in een "shush"-gebaar naar de thuisfans, die het als een provocatie beschouwden en de vleugelspeler de rest van de wedstrijd uitjoelden.
Harry Kane zorgde voor een 2-1 overwinning voor Bayern, maar Karl voelde de behoefte om zijn viering achteraf te verduidelijken.
"Het zijn de emoties die de overhand nemen. Het spijt me als de fans me verkeerd begrepen, dat was niet de bedoeling," zei Karl.
"De meeste voetbalfans weten dat het om emoties gaat, en dat het gewoon deel uitmaakt van het spel. Het spijt me daarover."
Elversberg, net gepromoveerd naar de Bundesliga, had gehoopt een grote verrassing te veroorzaken tegen de bezoekers, en hoewel de schok niet plaatsvond, leverde de thuisploeg een indrukwekkende prestatie en kwam dicht bij het behalen van een punt tegen de kampioenen voor hun eigen fans.
Middenvelder Maximilian Rohr was tevreden met de prestatie van zijn ploeg ondanks de nederlaag.
"We hebben misschien verloren, maar ik ben zo blij dat ik tegen zo'n team heb gespeeld," vertelde Rohr aan de officiële website van Bayern München. "Ik denk dat we het goed hebben gedaan, en we kunnen trots zijn op onze prestatie."
Elversberg heeft een solide start gemaakt in de Bundesliga, met zes punten uit drie wedstrijden na hun promotie, en reist volgende keer naar Schalke 04 voor hun aankomende competitiewedstrijd terwijl ze proberen voort te bouwen op een bemoedigende start.