Lyon zal tot €33,6 miljoen ontvangen voor de speler, inclusief €4,1 miljoen aan potentiële bonussen, volgens cijfers gepubliceerd door de Franse club. Lyon heeft ook een doorverkoopclausule van 10% behouden, terwijl Moreira's voormalige club Sporting Lisbon 20% van de vergoeding zal ontvangen op basis van een overeenkomst van zijn vorige transfer.
Bayer Leverkusen sportief directeur Simon Rolfes prees het profiel van de aanvaller in een verklaring.
"Afonso Moreira is een snelle, wendbare en lastige aanvaller met een goede afwerking en een uitstekend oog voor zijn teamgenoten," zei Rolfes.
"Zijn snelheid en intense speelstijl passen uitstekend bij ons team. Met Afonso winnen we extra vuurkracht en creativiteit in de aanvallende derde.
"We kijken uit naar een enorm spannende en ontwikkelbare speler in het shirt van onze Werkself."
Moreira genoot van een uitstekende seizoen bij Lyon, waarin hij acht doelpunten scoorde en 11 assists gaf in 37 competitieve optredens in alle competities. De Portugal Onder-21 international was ook gevolgd door Manchester United en andere clubs.
Terwijl hij sprak over zijn beslissing om naar Leverkusen te gaan, legde Moreira uit wat hem overtuigde om de overstap te maken.
"De verantwoordelijken toonden me, in gesprekken vol waardering, een duidelijke perspectief, gingen intensief om met mijn situatie en mijn doelen, en maakten duidelijk dat ze sterk in mijn potentieel geloven," zei Moreira. "Die erkenning betekende veel voor mij en was een belangrijke reden voor mijn beslissing in het voordeel van Leverkusen."
De ondertekening vertegenwoordigt een significante zakelijke zet voor Leverkusen terwijl ze hun selectie blijven hervormen na een zomer van vertrek, waarbij Moreira's combinatie van snelheid en eindproduct wordt gezien als een directe boost voor de aanvallende opties die beschikbaar zijn voor de nieuwe hoofdcoach Carles Martinez Novell voor het komende seizoen.