Mourinho had publiekelijk geprotesteerd tegen de scheidsrechterlijke beslissingen met betrekking tot Cuti Romero en Kang-in Lee na de wedstrijd, zelfs een stuk papier gepresenteerd met de incidenten tijdens zijn persconferentie.
Atletico Madrid hoofdcoach Diego Simeone had de managers al gewaarschuwd om voorzichtig te zijn met hun opmerkingen over scheidsrechters.
"We bevinden ons in een bevoorrechte positie, met een zeer hoog profiel als coaches en we moeten voorzichtig zijn met wat we zeggen. We moeten weten hoe we de scheidsrechter en onze collega's moeten respecteren."
Simeone voegde toe: "Wanneer je die lijn van respect overschrijdt, ongeacht of je naam Mourinho, Simeone, Flick of Pellegrini is, mag je de lijn niet overschrijden."
Baena was nog directer toen hem werd gevraagd naar Mourinho's reactie tijdens een interview met Telemadrid.
"Hij klaagt omdat hij heeft verloren," zei hij.
"Als het de andere kant op was gebeurd, zou er niet zoveel gepraat worden over deze scheidsrechterlijke controverse en dat is wat altijd gebeurt, dat wanneer Madrid verliest van Atlético ze proberen naar andere dingen te kijken in plaats van zich op zichzelf te concentreren."
Baena bekritiseerde ook Mourinho's beslissing om de incidenten naar zijn persconferentie te brengen.
"Een woede-uitbarsting? Het kan zo lijken voor mij. De show met de stukjes papier lijkt op een woede-uitbarsting en niet weten hoe te verliezen."