Une commission indépendante a déclaré Manchester City coupable d'accusations liées à des violations des règlements financiers de la Premier League entre les saisons 2009-10 et 2017-18.
La Premier League a déclaré que la commission avait constaté que le club avait organisé des accords commerciaux "faux" avec plusieurs sponsors dans le cadre d'un schéma de financement déguisé.
Manchester City a rejeté les conclusions et a déclaré qu'ils avaient l'intention de faire appel, arguant que l'opinion de la commission contient ce qu'ils décrivent comme des erreurs matérielles de droit, de principe et de fait.
Burnham a déclaré que le club devrait avoir l'opportunité de contester la décision par le biais du processus disponible.
"Je pense qu'il est juste de dire que c'est encore contesté maintenant," a-t-il déclaré.
"La Premier League a proclamé (Everton) coupable et je n'ai jamais accepté cela et donc il serait quelque peu injuste de ma part de porter un jugement sur un autre club de football.
"Mais ce sont des accusations très sérieuses, ne vous méprenez pas."
Burnham a précédemment fait campagne au nom d'Everton, son propre club, suite à la déduction de points qui leur a été imposée pour violations des règles financières.
Il a déclaré que cette expérience était une des raisons pour lesquelles il ne voulait pas porter un jugement immédiat sur le cas de City.
"Je me souviens que des gens proclamaient Everton coupable à l'époque," a déclaré Burnham.
"Et avec le recul, je pense que plus de gens diraient que ce n'était pas juste la façon dont cela a été géré. Donc il serait injuste de ma part de sauter d'un côté étant donné l'expérience que j'avais eue avant de devenir premier ministre."
Le Premier ministre a également défendu son bilan de relations avec Manchester City pendant son mandat de maire de la Grande Manchester.
Burnham a loué l'investissement réalisé par le City Football Group et la propriété plus large du club dans la zone autour du stade Etihad et à travers Manchester.
Interrogé sur la question de savoir si ces transactions résisteraient à l'examen, il a déclaré : "Oh en effet, je remercie en fait le City Football Group et la propriété plus large pour l'argent qu'ils n'ont pas seulement investi dans l'Etihad et le campus autour, mais aussi dans la ville, mais oui bien sûr."
Il a également déclaré qu'il serait préoccupé si les propriétaires de City décidaient finalement de vendre le club.
"Je serais vraiment inquiet de les perdre," a déclaré Burnham.
"Ils ont été un partenaire énorme dans la construction du Manchester moderne.
"Évidemment, la construction de Manchester City en la force mondiale qu'elle est."
Cependant, Burnham a souligné qu'il maintiendrait sa distance par rapport au processus légal et disciplinaire.
"Je ne m'implique pas directement dans le processus. Je n'ai parlé à personne directement à ce sujet," a-t-il déclaré.
"Je dois garder mes distances. Il serait injuste de ma part de faire quoi que ce soit d'autre. C'est un processus légal indépendant qui doit suivre son cours."
Burnham a également été interrogé sur la question de savoir s'il croyait que Manchester City devrait faire face à la relégation, mais a refusé de donner son avis.
"Il y a beaucoup en jeu. Soyons honnêtes à ce sujet, pour le club de football, pour les supporters de City, pour la ville de Manchester," a-t-il déclaré.
La Premier League a déclaré que la question des sanctions serait abordée séparément suite aux conclusions de culpabilité de la commission.
Manchester City devrait faire appel du verdict, ce qui signifie que le processus disciplinaire reste en cours.
Les commentaires de Burnham se concentrent donc sur la nécessité que le processus d'appel suive son cours avant que des conclusions finales ne soient tirées sur l'avenir du club.