Gakpo a signalé qu'il avait besoin d'être remplacé à la 17e minute après avoir semblé être affecté par deux défis forts en succession rapide.
Le joueur de 27 ans était en excellente forme tant pour son club que pour son pays et avait marqué lors du précédent match des Pays-Bas, un match nul 1-1 contre l'Allemagne jeudi.
Sa dernière blessure menace donc d'interrompre un début de saison productif.
La situation est particulièrement préoccupante pour Liverpool car le départ de Gakpo est survenu seulement quelques heures après qu'Alexander Isak a été écarté du reste des matches internationaux de la Suède en raison d'un problème à la cuisse.
Isak est déjà retourné à Liverpool pour une évaluation supplémentaire après avoir quitté le camp de la Suède.
Le sélectionneur de la Suède, Graham Potter, a décrit le problème de l'attaquant comme mineur mais a confirmé que le calendrier international chargé signifiait qu'il ne pourrait pas jouer.
"Il a un petit problème à la cuisse," a déclaré Potter.
"Ce n'est pas un gros problème mais en raison du nombre de matches que nous avons dans un court laps de temps, il ne pourra pas participer."
Potter a expliqué que la nature de la blessure d'Isak n'est devenue plus claire qu'après le match.
"C'était pendant le match. Comme pour tout, vous avez parfois des contusions et des ecchymoses dans le jeu, vous pourriez penser que c'est un coup à la cuisse ou quelque chose comme ça," a-t-il dit.
"Mais en réalité, au bout de 24 heures, 48 heures après le match, ce n'est pas tout à fait ce que vous pensez."
Isak manquera donc les trois derniers matches de la Suède pendant la trêve internationale.
Le personnel médical de Liverpool l'évaluera après son retour au club, bien que l'équipe de Premier League ne joue plus avant le 11 octobre, lorsqu'elle affrontera Manchester City.
Les Pays-Bas font désormais face à une attente similaire pour obtenir des éclaircissements concernant Gakpo.
L'attaquant avait commencé la trêve internationale en grande forme, et lui et Isak avaient déjà combiné pour quatre buts de Liverpool cette saison.
La dernière apparition internationale de Gakpo n'a duré que 17 minutes avant qu'il ne demande à sortir.
Le sélectionneur des Pays-Bas, Xavi Hernandez, était censé fournir une évaluation après le match.
Pour Liverpool, le timing crée une préoccupation de sélection indésirable.
Le club espérait revenir de la trêve internationale avec ses options offensives intactes, mais Isak est déjà indisponible pour la Suède et Gakpo doit maintenant être évalué après son départ anticipé à Belgrade.
La gravité de la blessure de Gakpo n'a pas encore été établie.
Liverpool attendra donc de plus amples informations médicales avant de savoir si l'un des deux attaquants sera disponible lorsque le football de club reprendra.