Eze llegó a través de la academia del Manchester City y representó a Inglaterra a nivel juvenil 13 veces antes de decidir dejar el club después de ocho años.
El adolescente confirmó su salida antes de que el Manchester United anunciara el movimiento el sábado.
"Después de ocho años inolvidables, he decidido dejar el Man City y comenzar un nuevo capítulo," escribió Eze en Instagram.
"Estoy agradecido por las oportunidades, desafíos y recuerdos que han dado forma tanto a mi carrera como a mí como persona."
Eze ahora se une al Manchester United, que recientemente también ha reclutado a otro jugador de la academia del City, Karim Cassim.
El movimiento continúa los esfuerzos del United por atraer talento joven de sus rivales locales, con Eze ahora comenzando una nueva etapa de su desarrollo en Old Trafford.