El delantero fue forzado a salir en la primera mitad del empate 2-2 de la Liga de Naciones del jueves por la noche en Ámsterdam tras recibir un desafío de Quinten Timber.
El entrenador de Alemania, Jürgen Klopp, dijo después del partido que no era probable que Havertz volviera a jugar durante el actual parón internacional.
Probablemente fuera para nosotros, pero con suerte también relativamente rápido disponible de nuevo," dijo Klopp.
La Asociación Alemana de Fútbol ha descrito el problema de Havertz como una distensión muscular, con el jugador de 27 años ahora dejando el campamento de la selección nacional para regresar a su club.
Más pruebas determinarán la extensión de la lesión, con Arsenal esperanzado en que Havertz ha evitado una baja significativa.
El tiempo da al delantero algo de tiempo para recuperarse, ya que Arsenal no volverá a jugar hasta que reciba a Leeds en el Emirates Stadium el 10 de octubre.
Havertz había tenido un fuerte comienzo de temporada tras superar problemas de lesiones que lo limitaron la temporada pasada. Marcó en la victoria de Arsenal en la Community Shield sobre Manchester City y había comenzado los cinco partidos de la Premier League.
También ya ha igualado su total de goles en liga de toda la temporada pasada, anotando dos veces en las primeras semanas de la campaña.
Arsenal ahora esperará los resultados de los exámenes adicionales antes de determinar cuánto tiempo podría estar indisponible Havertz.
Los problemas anteriores de isquiotibiales del delantero incluyeron una lesión sufrida durante un campamento de entrenamiento a mitad de temporada en Dubái que lo mantuvo fuera durante una parte significativa de la campaña 2024/25.