Villarreal confirmó el nombramiento en su sitio web oficial, con Pérez -- quien cumplió 38 años en enero -- firmando un contrato de tres años para reemplazar a Marcelino García Toral, quien decidió no extender su contrato después de guiar al club al tercer lugar en La Liga y la clasificación para la Champions League.
Pérez asume el cargo de entrenador por solo la segunda vez en su carrera, habiendo comenzado el rol en Rayo Vallecano en febrero de 2024 cuando sucedió a Francisco Rodríguez a mitad de temporada.
Anteriormente había sido asistente de Andoni Iraola en Vallecas, y originalmente iba a seguir a Iraola a Bournemouth antes de que un problema con el permiso de trabajo impidiera el traslado. Esa circunstancia lo dejó en España -- y, en última instancia, a cargo de una de las historias más notables del reciente fútbol español.
Guió al Rayo al octavo lugar en temporadas consecutivas de La Liga, los mejores finales consecutivos en la historia reciente del club, mientras también llevó al equipo madrileño a la final de la Conference League en Leipzig -- donde perdieron 1-0 ante Crystal Palace. Ningún entrenador del Rayo en los 102 años de historia del club había llevado al equipo a una final europea.
La ambición del Villarreal es ir más allá. Regresan a la Champions League por primera vez desde la temporada 2021-22, cuando eliminaron de manera famosa a la Juventus, Bayern Múnich y nuevamente a la Juventus antes de perder ante el Liverpool en las semifinales. Pérez tendrá la tarea de igualar y construir sobre el tercer lugar de Marcelino mientras el club se prepara para la competencia europea de élite.
Su nombramiento sigue el camino trazado por Iraola antes que él -- un entrenador del Rayo ascendiendo a un puesto más prominente en La Liga como recompensa por un trabajo que superó constantemente las expectativas.