Der Stürmer wurde in der ersten Halbzeit des 2:2-Unentschiedens in der Nations League am Donnerstagabend in Amsterdam nach einem Foul von Quinten Timber ausgewechselt.
Der deutsche Nationaltrainer Jürgen Klopp sagte nach dem Spiel, dass es unwahrscheinlich sei, dass Havertz während der aktuellen Länderspielpause wieder zum Einsatz kommt.
"Wahrscheinlich für uns aus, aber hoffentlich dann auch relativ schnell wieder verfügbar", sagte Klopp.
Der Deutsche Fußball-Bund hat Havertz' Problem als Muskelverspannung beschrieben, wobei der 27-Jährige nun das Nationalteam-Camp verlässt, um zu seinem Verein zurückzukehren.
Weitere Tests werden das Ausmaß der Verletzung bestimmen, wobei Arsenal hofft, dass Havertz eine längere Ausfallzeit vermeiden konnte.
Das Timing gibt dem Stürmer etwas Zeit zur Genesung, da Arsenal bis zum Heimspiel gegen Leeds im Emirates Stadium am 10. Oktober nicht mehr spielt.
Havertz hatte einen starken Saisonstart hingelegt, nachdem er Verletzungsprobleme, die ihn in der letzten Saison eingeschränkt hatten, überwunden hatte. Er erzielte ein Tor im Community Shield-Sieg von Arsenal über Manchester City und hatte alle fünf Premier-League-Spiele begonnen.
Er hat bereits seine Toranzahl in der Liga aus der gesamten letzten Saison erreicht, indem er in den ersten Wochen der Saison zweimal traf.
Arsenal wird nun auf die Ergebnisse der zusätzlichen Untersuchungen warten, bevor entschieden wird, wie lange Havertz möglicherweise ausfallen könnte.
Die vorherigen Probleme mit der Oberschenkelmuskulatur des Stürmers umfassten eine Verletzung, die er während eines Trainingslagers zur Saisonmitte in Dubai erlitt und die ihn für einen erheblichen Teil der Saison 2024/25 ausfallen ließ.