Der Stürmer wurde in der 67. Minute ausgewechselt, nachdem er anscheinend eine Verletzung erlitten hatte, wobei der Crystal Palace Stürmer Jorgen Strand Larsen ihn ersetzte.
Der Spielstand war 1-1, als Haaland das Spielfeld verließ, nachdem Kristoffer Ajer Norwegen in Führung gebracht hatte und Joao Cancelo vor der Halbzeit ausglich.
Goncalo Ramos vollendete dann Portugals Comeback weniger als 10 Minuten nach Haalands Abgang.
Der Vorfall trägt zu einer schwierigen Länderspielpause für Manchester City bei, die bereits Nico O'Reilly aufgrund einer Verletzung während seiner England-Verpflichtungen verloren haben.
Rico Lewis wurde aus der U21 befördert, um O'Reilly in Thomas Tuchels Kader zu ersetzen.
City wird besonders besorgt über Haaland sein, angesichts seiner Bedeutung für Enzo Marescas Mannschaft in dieser Saison. Der 26-Jährige hat in seinen ersten fünf Premier-League-Einsätzen fünf Tore erzielt.
Manchester City hat auch außerhalb des Platzes mit Unsicherheit zu kämpfen, nachdem sie für mehr als 100 der 130 gegen sie erhobenen Anklagen der Premier League für schuldig befunden wurden.
Der Verein betont nachdrücklich seine Unschuld und hat gegen das Urteil Berufung eingelegt, wobei die Strafe noch festgelegt werden muss.
Haalands Zustand wird daher genau beobachtet, bevor City nächste Woche zum Vereinsfußball zurückkehrt.
Die Etihad-Seite soll am Sonntag Liverpool in ihrem ersten Spiel nach dem Schuldspruch gegenüberstehen, was die Fitness des Stürmers zu einem besonders wichtigen Anliegen macht.