Der kamerunische Nationalspieler wurde kurz nach der Halbzeitpause im Old Trafford ausgewechselt, nachdem er zum ersten Mal zusammen mit Kobbie Mainoo im Mittelfeld begonnen hatte.
Baleba war zu Beginn der zweiten Halbzeit nach vorne gestürmt und schien bereit, eine gefährliche Möglichkeit zu kreieren, als er plötzlich mit Unbehagen stehen blieb. Er konnte nicht weitermachen, und Youri Tielemans wurde an seiner Stelle eingewechselt.
Carrick bestätigte nach dem Spiel, dass das Problem Balebas Oberschenkelmuskel war, obwohl der Verein weitere Untersuchungen durchführen müsste, bevor die Schwere des Problems festgestellt werden kann.
"Ich habe zu diesem Zeitpunkt keine weiteren Neuigkeiten zu Carlos, aber es ist sein Oberschenkelmuskel", sagte der Trainer von United.
"Wir müssen beurteilen, wie das aussieht, aber zunächst sieht es nicht gut aus."
Die Verletzung kam zu einem schwierigen Zeitpunkt für United, die zur Halbzeit mit 0-2 zurücklagen, nachdem Matías Soulé und Donyell Malen getroffen hatten. Bruno Fernandes verwandelte einen Elfmeter, bevor Matheus Cunha zweimal traf, um ein bemerkenswertes Comeback zu vollenden.
Tielemans leistete einen positiven Beitrag, nachdem er Baleba ersetzt hatte, und erhielt Lob von Carrick für die Art und Weise, wie er mit den Umständen umging.
"Ich dachte, Youri ist ins Spiel gekommen und hat gezeigt, was er kann, seine Persönlichkeit und seinen Charakter, die er ins Team einbringt", sagte Carrick.
"Er ist ein großartiger Mensch, ich liebe es, ihn für alles, was er mitbringt, um mich zu haben."
Die Leistung des Belgiers könnte seinen Anspruch auf einen Stammplatz stärken, wenn Manchester United am Sonntag im Old Trafford gegen Aston Villa spielt.
Balebas Abwesenheit wäre ein Rückschlag für Carrick, insbesondere nachdem der Mittelfeldspieler zum ersten Mal von Anfang an mit Mainoo gepaart wurde. United wird nun auf die Ergebnisse weiterer Untersuchungen warten, bevor sie wissen, ob er für die kommenden Spiele zur Verfügung stehen wird.