Musiala hat seit seinem Zusammenbruch auf dem Platz in aufeinanderfolgenden Testspielen gegen RB Leipzig und Heidenheim im letzten Monat nicht mehr für Bayern gespielt.
Der 23-Jährige bestätigte später auf Instagram, dass bei ihm Abwesenheitsanfälle aufgrund einer neurologischen Dysfunktion diagnostiziert wurden, und fügte hinzu, dass kein zusätzliches Gesundheitsrisiko bestehe und dass er beabsichtige, wie gewohnt weiterzuspielen.
Bayern München hat erklärt, dass die Episoden durch eine Änderung der Medikation ausgelöst wurden, die er wegen der Erkrankung eingenommen hatte, von der der Verein seit der letzten Saison wusste.
In einem Gespräch mit ARD am Dienstagabend erklärte Eberl den Ansatz des Vereins, den Mittelfeldspieler wieder ins Spiel zu bringen.
"Bei Jamal ist die Situation so, dass wir nach den letzten beiden Vorfällen versuchen, eine Phase ohne Anfälle aufzubauen," sagte Eberl.
"Ich glaube, es kann komplett verschwinden -- das ist die große Hoffnung -- aber das ist schwierig. Zuerst diese anfallsfreie Phase, und sobald die da ist, kann er wieder mit uns auf dem Platz stehen."
Bayern trifft am Samstag auswärts auf Schalke in ihrem zweiten Bundesliga-Spiel der Saison, und Cheftrainer Vincent Kompany war vorsichtig, als er gefragt wurde, ob Musiala möglicherweise beteiligt sein könnte.
"Vielleicht. Aber ich möchte dem Jungen keinen zusätzlichen Druck machen," sagte Kompany bei Sky. "Es geht ihm gut, es wird besser. Wenn es so weitergeht, wird es nicht mehr lange dauern."
Kompany bestätigte, dass Musiala fit ist und das volle Training mit der Mannschaft wieder aufgenommen hat.
Woanders sprach Eberl auch über die laufenden Vertragsgespräche mit Harry Kane, der in Bayerns DFB-Pokal-Sieg über VfL Osnabrück zweimal traf und damit seine treffsichere Bilanz vor dem Tor fortsetzte.
Der aktuelle Vertrag des 32-Jährigen läuft am Ende der Saison aus, wobei die Länge einer möglichen Verlängerung der Hauptstreitpunkt ist -- Bayern möchte ihn bis 2029 binden, während Kane angeblich einen Vertrag bis 2030 bevorzugt.
"Es ist relativ, das als Formsache zu bezeichnen," sagte Eberl. "Die Gespräche müssen stattfinden, genau wie die Spiele gespielt werden müssen, das ist klar. Was gesagt werden kann, ist, dass beide Seiten es wollen, und dann sollte es klappen. Ob es einfach wird, weiß ich nicht, aber wir bleiben zuversichtlich."