Aston Villa hatte am Freitag angekündigt, dass sie rechtliche Schritte gegen den ehemaligen Liverpool-Verteidiger einleiten wollten wegen dessen, was sie als "unacceptable insults" während eines Auftritts im Stick to Football-Podcast bezeichneten.
Der Streit drehte sich um Carraghers Kommentare zu Unai Emery und der Möglichkeit, dass der Villa-Trainer Michael Carrick bei Manchester United ersetzen könnte.
Carragher deutete an, dass Emery von der Möglichkeit angezogen werden würde, einen weiteren großen europäischen Verein zu leiten, und argumentierte, dass der Fußball nach einer Hierarchie funktioniert, in der größere Teams die besten Spieler und Trainer von den kleineren abwerben können.
"Es gibt eine Kette im Fußball, ob es dir gefällt oder nicht", sagte er.
"Also wird Real Madrid den besten Spieler von Manchester United holen, sie haben es mit [Cristiano] Ronaldo getan. Und es wird Teams unter Aston Villa geben, die ihre Spieler oder Trainer abwerben werden.
"Aston Villa wird niemals Manchester United sein."
Die Kommentare führten zu einer wütenden Reaktion der Villa-Anhänger, wobei Carragher denjenigen, die ihn kritisierten, anschließend sagte, sie sollten "den Mund halten".
Die Antwort des Vereins war ungewöhnlich stark, wobei Eigentümer Nassef Sawiris ankündigte, dass Villa rechtliche Schritte wegen der Bemerkungen einleiten würde.
Carragher entschuldigte sich jedoch am Samstag und erkannte an, dass seine Wortwahl unangemessen gewesen war und dass sein beabsichtigter Humor nicht so verstanden wurde, wie er es erwartet hatte.
"Ich möchte mich bei Aston Villa, den Eigentümern und ihren Fans entschuldigen", schrieb er in sozialen Medien.
"Meine Sprache in dieser Woche war ungeschickt und falsch.
"Ich kann den Villa-Fans versichern, dass es ironisch gemeint war, aber ich kann verstehen, dass es nicht so rüberkam, also Entschuldigung."
Villa hat nun beschlossen, nach der Entschuldigung nicht mit der rechtlichen Drohung fortzufahren. Der Verein hatte vor der Rücknahme seiner Absicht keine formellen Verfahren eingeleitet.