Ugarte, 25, liep een kniebandblessure op tijdens de laatste groepswedstrijd van Uruguay op het Wereldkampioenschap tegen Spanje en werd op een brancard van het veld gedragen, nadat hij ongelukkig was geland in een duel met Barcelona's Pedri.
De Uruguayaan begon in alle drie de groepswedstrijden van zijn land voordat ze uitgeschakeld werden en plaatste daarna op sociale media dat hij "de ernstigste blessure heeft opgelopen die een voetballer kan krijgen."
Een clubverklaring luidde: "Manchester United kan bevestigen dat Manuel Ugarte met succes is geopereerd aan een kniebandblessure, die hij opliep terwijl hij Uruguay vertegenwoordigde op het FIFA Wereldkampioenschap.
"Ugarte zal nu beginnen met de revalidatiefase van zijn herstel en zal zorgvuldig worden begeleid door de medische en prestatiemedewerkers van de club.
"Iedereen bij Manchester United wenst Manuel veel succes met zijn herstel en zal hem in elke stap van de weg ondersteunen."
United heeft niet de exacte aangetaste band bekendgemaakt of een exacte herstelperiode gegeven, hoewel rapporten suggereren dat er een periode van zes tot twaalf maanden is, wat betekent dat Ugarte waarschijnlijk pas diep in het seizoen 2026-27 weer in actie zal komen.
Het verzekeringsschema van Fifa zal helpen een deel van Ugarte's salaris, dat naar verluidt rond de £120.000 per week ligt, tijdens zijn afwezigheid te dekken. Het bestuursorgaan betaalt dagelijks vanaf de 29e dag van een blessure, waarbij United naar verwachting ongeveer £13.500 per dag zal ontvangen tot een totaalplafond van £5,6 miljoen.
Mocht Ugarte negen maanden aan de kant blijven, dan zou United ongeveer 244 dagen compensatie ontvangen, wat neerkomt op ongeveer £3,29 miljoen, hoewel het schema geen gemiste bonussen dekt.
Manchester United was van plan om Ugarte deze zomer te verkopen na twee moeilijke seizoenen na zijn komst van £50 miljoen van Paris Saint-Germain in 2024, waarbij hij vorig seizoen slechts 22 Premier League-optredens maakte, waarvan er slechts acht als basisstart. Die plannen liggen nu stil, terwijl de club in plaats daarvan verwacht verdere dekking op het middenveld te brengen na de blessure, nadat ze deze zomer al Andrey Santos en Youri Tielemans hebben getekend.
Ugarte, die op 15 juli onder het mes ging, schreef later op Instagram: "Er zijn een paar dagen verstreken sinds alles gebeurde. Het raken van de bodem zal me in elke zin sterker maken, en ik geloof echt dat dat hier het geval is."
Hij bedankte zowel de Uruguyaanse federatie als Manchester United voor hun steun.
United speelt dit weekend tegen Wrexham in hun eerste oefenwedstrijd van het seizoen terwijl manager Michael Carrick zijn middenvelkeuze blijft hervormen.