"Het is niet het exacte probleem, het is een vergelijkbaar gebied, maar het is niet precies hetzelfde," zei Carrick.
"En we zijn er nog steeds een beetje mee bezig om te zien hoe lang het probleem zal duren.
"We hopen dat het snel zal zijn, dat is duidelijk, maar op dit moment is het nog niet helemaal duidelijk."
Sesko is niet beschikbaar geweest sinds hij uitviel tijdens Manchester United's League Cup nederlaag tegen Brighton op 16 september. Zijn laatste tegenslag heeft verdere vragen opgeworpen over een probleem dat zijn vooruitgang de afgelopen maanden heeft verstoord.
De Sloveense international had al internationale verplichtingen in maart gemist om zijn scheenbeen te rusten voordat hij de blessure verergerde in United's 3-2 overwinning op Liverpool op 3 mei. Hij was vervolgens drieënhalve maand uit de running.
Carrick benadrukte dat het huidige probleem geen exacte herhaling was van de oorspronkelijke blessure, hoewel het een vergelijkbaar gebied beïnvloedt.
Toen hem werd gevraagd of United een operatie zou overwegen, bevestigde de manager dat die mogelijkheid niet was uitgesloten.
"Ja, er zijn verschillende dingen om naar te kijken," zei hij.
"Ik denk dat hij eigenlijk heel goed herstelde van de eerste, en er was veel tijd, en soms komen er dingen naar voren.
"Het lichaam doet bepaalde dingen en we moeten daarop reageren en proberen hem zo snel mogelijk terug te krijgen."
United is daarom nog steeds bezig met de beschikbare opties in plaats van zich te committeren aan een specifieke behandelingswijze. Carrick gaf geen vaste terugkeerdatum, waardoor Sesko's beschikbaarheid voor de komende wedstrijden van de club onzeker blijft.
De aanvaller zal waarschijnlijk niet klaar zijn voor de uitwedstrijden tegen Atletico Madrid en Leeds volgende week, wat de selectieproblemen van United vergroot terwijl ze hun resultaten willen verbeteren.
Sesko heeft dit seizoen twee keer gescoord, maar zijn afwezigheid laat Carrick zonder een van zijn aanvallende opties op een moment dat United meer consistentie nodig heeft.
De manager heeft ook opgeroepen tot meer intensiteit van zijn spelers na een moeilijke start van de Premier League campagne. United won slechts één van hun eerste vijf competitiewedstrijden voor de verlengde interlandbreak.
Carrick wil dat zijn team meer agressie en urgentie toont wanneer ze weer in actie komen, maar eerst moet hij de blessures die zijn selectie beïnvloeden beheren.
Voor Sesko blijft de onmiddellijke prioriteit het vinden van een oplossing voor het scheenbeenprobleem. Met de exacte herstelperiode nog onduidelijk, zal United moeten wachten voordat ze weten wanneer hij weer regelmatig kan spelen.