De middenvelder werd gewisseld in de rust tijdens de Champions League ontmoeting van dinsdag met Aston Villa, nadat hij ongemak in zijn rechterbeen had ervaren. Tests die woensdag werden uitgevoerd, bevestigden een kleine blessure aan de biceps femoris spier, waardoor hij niet mee kan naar de Metropolitano.
De club heeft geen specifieke datum voor herstel gegeven, aangezien zijn terugkeer afhankelijk is van hoe de blessure zich ontwikkelt.
"Rodrigo Hernández heeft medische tests ondergaan na het spierongemak dat hij voelde tijdens de wedstrijd van gisteren tegen Aston Villa," zei Barcelona in een verklaring.
"De tests bevestigen dat hij een kleine blessure aan de biceps femoris spier in zijn rechterbeen heeft opgelopen. Hij zal de wedstrijd van aanstaande zondag tegen Atletico Madrid missen. De exacte hersteltijd zal afhangen van de ontwikkeling van de blessure."
Hansi Flick had na de wedstrijd tegen Aston Villa aangegeven dat het probleem aanvankelijk niet ernstig leek.
"Ik wisselde Rodri omdat hij een beetje ongemak had," legde de coach van Barcelona uit.
De blessure brengt een einde aan een lange reeks optredens voor de 30-jarige, die zijn debuut voor Barcelona maakte tegen Athletic Club op 27 augustus. Sindsdien heeft hij in alle wedstrijden van de club in LaLiga en de Champions League gespeeld, met in totaal 945 minuten in 14 optredens.
Rodri is in 11 van die wedstrijden begonnen en is een belangrijk onderdeel geworden van Flick's middenvelderspartnerschap met Pedri. Zijn vermogen om balbezit te herstellen, het tempo te controleren en het spel te dicteren, heeft hem een vaste keuze gemaakt, terwijl de coach beperkte mogelijkheden had om hem rust te geven.
Zijn afwezigheid tegen Atletico is daarom een aanzienlijke tegenslag, terwijl het tijdstip ook twijfels oproept over zijn beschikbaarheid voor de eerste wedstrijden van Barcelona na de interlandbreak.
De club heeft al verschillende spelers die apart van de hoofdgroep trainen, waaronder Roony Bardghji, Andreas Christensen, Dani Olmo, Eric García, Jules Koundé en Xavi Espart.
Barcelona zal nu Rodri's herstel volgen voordat ze bepalen wanneer hij weer kan terugkeren naar het veld.