Una commissione indipendente ha trovato il City colpevole di accuse relative a violazioni delle normative finanziarie della Premier League tra le stagioni 2009-10 e 2017-18.
La Premier League ha dichiarato che la commissione ha trovato che il club ha organizzato affari commerciali "fittizi" con diversi sponsor come parte di uno schema di finanziamento mascherato.
Il Manchester City ha respinto le conclusioni e ha dichiarato che intende fare appello, sostenendo che l'opinione della commissione contiene quelli che descrivono come errori materiali di legge, principio e fatto.
Burnham ha detto che il club dovrebbe avere l'opportunità di contestare la decisione attraverso il processo disponibile.
"Penso sia giusto dire che è ancora contestato ora," ha detto.
"La Premier League ha proclamato (Everton) colpevole e io non l'ho mai accettato e quindi sarebbe un po' sbagliato da parte mia saltare a giudizio su un altro club di calcio.
"Ma sono accuse molto serie, non fraintendetemi."
Burnham ha precedentemente fatto campagna a favore dell'Everton, il suo club, dopo la penalizzazione dei punti imposta per violazioni delle regole finanziarie.
Ha detto che quell'esperienza è stata una delle ragioni per cui non voleva fare un giudizio immediato sul caso del City.
"Ricordo che la gente proclamava colpevole l'Everton all'epoca," ha detto Burnham.
"E con il senno di poi, penso che più persone direbbero che non era giusto il modo in cui è stata gestita. Quindi sarebbe sbagliato da parte mia schierarmi da una parte data l'esperienza che avevo avuto prima di diventare primo ministro."
Il Primo Ministro ha anche difeso il suo operato nei rapporti con il Manchester City mentre serviva come sindaco della Grande Manchester.
Burnham ha elogiato l'investimento effettuato dal City Football Group e dalla proprietà più ampia del club nell'area attorno all'Etihad Stadium e in tutta Manchester.
Interrogato se quegli affari reggerebbero all'esame, ha detto: "Oh, in effetti, ringrazio davvero il City Football Group e la proprietà più ampia per i soldi che non hanno messo solo nell'Etihad e nel campus attorno ad esso, ma anche nella città, ma sì, certo."
Ha anche detto che sarebbe preoccupato se i proprietari del City decidessero infine di vendere il club.
"Sarei davvero preoccupato di perderli," ha detto Burnham.
"Sono stati un partner così importante nella costruzione della moderna Manchester.
"Ovviamente, la costruzione del Manchester City come forza globale che è."
Tuttavia, Burnham ha sottolineato che manterrà la sua distanza dal processo legale e disciplinare.
"Non mi sto coinvolgendo direttamente nel processo. Non ho parlato con nessuno direttamente riguardo a ciò," ha detto.
"Devo mantenere la mia distanza da esso. Sarebbe sbagliato da parte mia fare qualsiasi altra cosa. È un processo legale indipendente che deve seguire il suo corso."
Burnham è stato anche interrogato se credeva che il Manchester City dovesse affrontare la retrocessione, ma ha rifiutato di esprimere un'opinione.
"C'è molto in gioco. Siamo onesti su questo, per il club di calcio, per i sostenitori del City, per la città di Manchester," ha detto.
La Premier League ha dichiarato che la questione delle sanzioni sarà affrontata separatamente dopo le conclusioni di colpevolezza della commissione.
Si prevede che il Manchester City faccia appello contro il verdetto, il che significa che il processo disciplinare rimane in corso.
I commenti di Burnham si concentrano quindi sulla necessità che il processo di appello segua il suo corso prima che vengano tratte conclusioni definitive sul futuro del club.