Il Benfica ha confermato che pagherà 14 milioni di euro per il 31enne, con il Bayern che potrà guadagnare ulteriori 5 milioni di euro in bonus, e Palhinha ha firmato un contratto che scadrà nell'estate del 2030.
Il direttore sportivo Max Eberl ha spiegato il pensiero dietro il lasciar partire il nazionale portoghese: "Abbiamo discusso apertamente della situazione di João Palhinha con lui e trovato una soluzione su cui possiamo tutti concordare.
"Ha deciso di continuare la sua carriera nel suo paese d'origine. Lo ringraziamo per il suo tempo al FC Bayern e gli auguriamo il meglio per il futuro."
Il Bayern ha firmato Palhinha dal Fulham nell'estate del 2024 per una cifra intorno ai 50 milioni di euro, arrivando con la reputazione di uno dei centrocampisti più combattivi della Premier League dopo due stagioni produttive a Londra ovest, ma non è riuscito a forzare il suo ingresso in un ruolo di titolare consolidato a Monaco, facendo solo 25 presenze senza gol né assist, e ha passato la scorsa stagione in prestito al Tottenham, dove ha segnato cinque gol e aggiunto due assist in 33 presenze in Premier League.
Palhinha, che ha iniziato la sua carriera allo Sporting prima di trasferirsi in Inghilterra, ha inquadrato il passaggio al Benfica come un ritorno in un ambiente esigente.
"Le aspettative sono molto alte, come sappiamo tutti, quando rappresenti il Benfica," ha detto. "E in questo momento sono solo un altro che aiuta, dando tutto per il club.
"Non ho dubbi che l'intera struttura, tutti i tifosi, desiderano anche vincere titoli."
Il trasferimento riporta Palhinha nel calcio portoghese per la prima volta da quando ha lasciato lo Sporting CP per il Fulham nel 2022. Arriva al Benfica come un centrocampista difensivo esperto con un recente pedigree di alto livello sia in Germania che in Inghilterra, offrendo al club un'ulteriore opzione mentre continua a plasmare la sua rosa per la stagione a venire.