Fernandez a finalement obtenu ce qu'il souhaitait sous la forme d'un transfert de 125 millions de livres à Manchester City le jour de la date limite, un montant qui égalait le record britannique de transfert établi par la signature d'Alexander Isak par Liverpool l'été précédent, après avoir flirté plus tôt avec un transfert vers le Real Madrid. Chelsea a tenu bon pour obtenir le montant maximum possible avant de sanctionner la vente, mais le retard les a laissés sans remplaçant au milieu de terrain après qu'une tentative tardive de signer Lamine Camara de Monaco a échoué lorsque le club français s'est retiré de l'accord, un développement qui aurait laissé la hiérarchie de Chelsea furieuse.
Le vice-capitaine Fernandez a estimé qu'il n'avait plus de relation avec ses coéquipiers de Chelsea et a soumis non pas une mais deux demandes de transfert écrites pendant l'été dans sa volonté de forcer un départ de Stamford Bridge.
Son temps à l'ouest de Londres avait déjà été tumultueux bien avant cela. Le club l'a soutenu après qu'il ait été filmé en train de chanter un chant raciste sur l'équipe nationale française, et a continué à lui donner du temps de jeu la saison dernière malgré ce qui était largement perçu comme un manque de respect public envers le club. Sur le terrain, cependant, Chelsea a réalisé un bénéfice sain sur l'accord, et Fernandez était une figure clé de l'équipe qui a remporté la Coupe du Monde des Clubs et la Ligue de la Conférence en tant que l'une des premières grandes recrues de l'ère de propriété de BlueCo.
Sa conduite contrastait fortement avec celle de Pedro Neto, qui a récemment été récompensé par un nouveau contrat courant jusqu'en 2032 malgré l'intérêt de Manchester City et de la Saudi Pro League, choisissant plutôt de se battre pour sa place sous Xabi Alonso et d'embrasser un nouveau rôle d'arrière latéral.
Fernandez avait également critiqué publiquement le club la saison dernière pour sa décision de laisser Enzo Maresca partir pour Manchester City, disant qu'il ne comprenait pas le raisonnement derrière la sanction de l'exit de l'Italien.
"Je ne comprends pas. Parfois, il y a des choses que nous, en tant que joueurs, ne comprenons pas, comment et de quelle manière ils essaient de gérer les choses," a déclaré Fernandez à l'époque. "Évidemment, c'était un départ qui nous a beaucoup blessés, surtout en plein milieu de la saison, ça coupe tout court. Nous avions une identité.
"Il nous a donné un ordre, même si, comme c'est souvent le cas dans le football, parfois c'est bon et mauvais. Mais il avait toujours une identité très claire en ce qui concerne l'entraînement et le jeu."
Fernandez et Maresca sont restés en contact régulier après le départ de l'Italien, une amitié qui aurait déçu Chelsea envers leur vice-capitaine durant une période difficile tant sur le terrain qu'en dehors, même s'il n'y a rien contre les joueurs restant en contact avec d'anciens entraîneurs. Maresca a fait de Fernandez sa priorité numéro un en matière de transfert alors que City renouvelait son milieu de terrain cet été, en recrutant également Ayyoub Bouaddi et Elliot Anderson tout en permettant à Rodri de partir pour Barcelone.