L'ancien défenseur de Liverpool avait suscité une controverse majeure après avoir suggéré qu'Emery pourrait être tenté par l'opportunité de diriger Manchester United si Michael Carrick perdait son poste à Old Trafford.
Les commentaires de Carragher, faits lors d'une apparition sur The Overlap, ont mis en colère les supporters de Villa, en particulier après qu'il ait suggéré qu'il y avait une hiérarchie dans le football qui plaçait Manchester United au-dessus de leur club.
La situation a dégénéré lorsque Carragher a répondu aux critiques des supporters de Villa en leur disant de "fermer leur grande gueule", avant de réitérer qu'Aston Villa ne serait jamais Manchester United.
Villa a ensuite publié un communiqué vendredi soir, signé par le copropriétaire et président Nassef Sawiris, annonçant leur intention d'engager des poursuites judiciaires.
Aston Villa engagera des poursuites judiciaires contre Jamie Carragher pour ses insultes inacceptables à propos du Club et de ses fans.
Aston Villa ne permettra à personne d'arrêter notre ascension dans le football anglais et européen.
Nassef Sawiris, Président."
Le communiqué représentait une escalade significative dans le différend, qui s'était initialement centré sur l'évaluation de Carragher concernant Emery et la possibilité que l'Espagnol se rende à Old Trafford.
Cependant, le consultant de Sky Sports a changé de position samedi, présentant des excuses publiques au club et à ses supporters.
Je tiens à m'excuser auprès d'Aston Villa, des propriétaires et de leurs fans," a écrit Carragher sur les réseaux sociaux.
Mon langage cette semaine était maladroit et erroné. Je peux assurer aux fans de Villa que c'était sur le ton de la plaisanterie mais je comprends que cela n'ait pas été perçu de cette manière, donc je m'excuse.
Bonne chance aujourd'hui UTV !"
L'argument original de Carragher était centré sur sa conviction qu'Emery, qui a connu un succès considérable dans le football européen, pourrait raisonnablement envisager un transfert vers un club avec l'histoire et les ressources de Manchester United.
L'Espagnol a établi un impressionnant palmarès à Villa, y compris en menant le club de retour en Ligue des champions et en supervisant des progrès continus dans les compétitions nationales et européennes.
Carragher s'était demandé si Emery voudrait finalement une autre opportunité de rivaliser pour les plus grands honneurs du jeu, ayant précédemment dirigé le Paris Saint-Germain et Arsenal.
Je pense qu'Unai Emery est incroyable avec ce qu'il fait année après année," avait déclaré Carragher, louant la capacité de l'entraîneur à superviser des changements substantiels dans son effectif tout en maintenant des standards compétitifs.
Cependant, sa suggestion que Villa ne pouvait pas égaler le statut de Manchester United dans le football s'est révélée particulièrement impopulaire auprès des supporters.
Les excuses sont intervenues alors que Villa se préparait pour son match de Premier League contre Manchester City, le club ayant clairement indiqué qu'il n'accepterait pas ce qu'il considérait comme des attaques inacceptables sur son identité et ses supporters.
Il reste incertain de savoir si les excuses de Carragher seront suffisantes pour mettre fin à l'affaire, Villa ayant annoncé publiquement son intention d'engager des poursuites judiciaires.