Según múltiples informes de medios alemanes, el exdefensor del Bayern Múnich Martin Demichelis, de 45 años, es el principal candidato para reemplazarlo.
Werner, de 38 años, asumió el cargo en Leipzig el verano pasado con un contrato que se extiende hasta 2027, llegando desde el Werder Bremen después de guiarlos en 128 partidos.
Llevó al RB Leipzig al tercer lugar en la Bundesliga esta temporada, terminando con 65 puntos, solo dos menos que el propio récord del club.
Ese resultado aseguró la clasificación para la Liga de Campeones para la próxima temporada.
A pesar de esos resultados, los informes sugieren que ha habido insatisfacción interna con el estilo de juego de Werner y con lo estrecho que fue lograr la clasificación para la Liga de Campeones.
Según Sky Sport Alemania, las fuentes apuntan a la infelicidad del presidente del consejo de supervisión Oliver Mintzlaff y del departamento de fútbol global del club, que incluye a Jurgen Klopp y Mario Gomez.
Demichelis, que actualmente dirige al RCD Mallorca, asumió el cargo del club español en febrero con un contrato que se extiende hasta 2028.
A pesar de ese contrato, los informes desde España sugieren que está listo para dejar Mallorca por Leipzig, con el medio español Marca describiendo el movimiento como efectivamente acordado.
El canal sudamericano BolaVip informó que Red Bull está preparado para pagar una tarifa de compensación de alrededor de 3 millones de euros para asegurar sus servicios.
Como jugador, Demichelis pasó tiempo tanto en el Manchester City como en el Bayern Múnich durante una carrera mayormente centrada en el puesto de defensa central.
Werner no fue la primera opción de Leipzig cuando lo nombraron el verano pasado.
El club había intentado supuestamente fichar a Cesc Fabregas, quien en cambio permaneció en Como y llevó al club italiano a la Liga de Campeones.
El director ejecutivo de Leipzig, Marcel Schafer, había indicado previamente una disposición a discutir un nuevo contrato con Werner tras la clasificación del club para la Liga de Campeones.
Sin embargo, a principios de junio había comenzado a retroceder públicamente, citando una revisión de fin de temporada en curso.
Esa revisión ahora parece haber concluido, con informes que sugieren un resultado desfavorable para Werner.
Leipzig entra en la nueva temporada habiendo perdido ya a jugadores clave en ataque, con Xavi Simons, Loic Openda y Benjamin Sesko todos saliendo el verano pasado.
Un cambio de entrenador tan pronto después de la llegada de Werner marcaría otro reinicio para un club que ha pasado por varios entrenadores en las últimas temporadas.
Para Demichelis, un movimiento a Leipzig representaría un paso significativo hacia arriba desde Mallorca y un regreso a una de las posiciones de entrenador más destacadas de Europa.
Nada ha sido confirmado aún por ninguno de los clubes, pero el volumen y la consistencia de los informes desde Alemania y España sugieren que un anuncio podría no estar lejos.