Los Saints fueron eliminados de la final de playoffs del sábado contra Hull City tras admitir haber espiado las sesiones de entrenamiento de Middlesbrough, Ipswich Town y Oxford United.
Middlesbrough, que perdió 2-1 en el global ante Southampton en las semifinales, ha sido restablecido a la espera de una audiencia de apelación.
El analista del club Will Salt fue supuestamente sorprendido filmando el entrenamiento de Middlesbrough desde detrás de un árbol antes de usar su tarjeta de débito en un café de un club de golf cercano.
Le Tissier cree que el castigo supera con creces la ofensa.
"Se siente como si te hubieran puesto en juicio por asesinato cuando todo lo que has hecho es robar una barra de Mars de la tienda de la esquina," dijo Le Tissier. The Sun.
"Eso es lo que me parece a mí."
El exdelantero de Southampton argumentó que simular faltas para penales tiene un impacto directo mayor en los partidos de fútbol que recopilar información sobre las sesiones de entrenamiento del oponente.
"Cuando no te ha tocado un oponente y te caes en el área, eso es un engaño flagrante," dijo.
"Y eso es algo que tendrá un impacto mucho mayor en un partido."
La eliminación de Southampton de los playoffs costará al club el acceso a la Premier League, con una promoción estimada en alrededor de £215 millones.
Le Tissier sugirió que el castigo equivale efectivamente a una penalización financiera de alrededor de £100 millones dada la oportunidad del club de ganar la promoción.
Los Saints habían entrado en los playoffs con una racha de 21 partidos invictos bajo el mando del entrenador Tonda Eckert antes de que surgiera el escándalo.
Le Tissier también cuestionó si la EFL había considerado plenamente las consecuencias más amplias de su fallo, con los preparativos de Hull interrumpidos y Wrexham supuestamente explorando vías legales si la expulsión de Southampton se mantiene.
"No estoy seguro de si pensaron en todas las ramificaciones," dijo.
"Va a ser complicado."
El exinternacional inglés reservó particular simpatía para los aficionados y jugadores de Southampton, muchos de los cuales ahora enfrentan la posibilidad de perder una oportunidad en la Premier League debido a circunstancias fuera de su control.