El exdefensor del Liverpool había provocado una gran controversia tras sugerir que Emery podría sentirse tentado por la oportunidad de dirigir al Manchester United si Michael Carrick perdía su puesto en Old Trafford.
Los comentarios de Carragher, realizados durante una aparición en The Overlap, enfurecieron a los aficionados del Villa, especialmente después de que sugiriera que había una jerarquía en el fútbol que colocaba al Manchester United por encima de su club.
La situación se intensificó cuando Carragher respondió a las críticas de los aficionados del Villa diciéndoles que "se callaran", antes de reiterar que el Aston Villa nunca sería el Manchester United.
El Villa emitió posteriormente un comunicado el viernes por la noche, firmado por el copropietario y presidente Nassef Sawiris, anunciando su intención de emprender acciones legales.
"Aston Villa iniciará acciones legales contra Jamie Carragher por sus insultos inaceptables sobre el Club y sus aficionados.
"Aston Villa no permitirá que nadie detenga nuestra ascensión en el fútbol inglés y europeo.
"Nassef Sawiris, Presidente."
El comunicado representó una escalada significativa en la disputa, que inicialmente se centró en la evaluación de Carragher sobre Emery y la posibilidad de que el español se trasladara a Old Trafford.
Sin embargo, el comentarista de Sky Sports cambió su posición el sábado, emitiendo una disculpa pública al club y a sus aficionados.
"Me gustaría disculparme con Aston Villa, los propietarios y sus aficionados," escribió Carragher en las redes sociales.
"Mi lenguaje esta semana fue torpe y equivocado. Puedo asegurar a los aficionados del Villa que fue en tono de broma, pero entiendo que no se haya percibido de esa manera, así que pido disculpas.
"¡Buena suerte hoy UTV!"
El argumento original de Carragher se centraba en su creencia de que Emery, quien ha disfrutado de un considerable éxito en el fútbol europeo, podría considerar razonablemente un traslado a un club con la historia y los recursos del Manchester United.
El español ha establecido un impresionante récord en el Villa, incluyendo llevar al club de regreso a la Champions League y supervisar el progreso continuo en la competición nacional y europea.
Carragher había cuestionado si Emery eventualmente querría otra oportunidad para competir por los mayores honores en el juego, habiendo dirigido anteriormente al Paris Saint-Germain y al Arsenal.
"Creo que Unai Emery es increíble con lo que hace año tras año," había dicho Carragher, elogiando la capacidad del entrenador para supervisar cambios sustanciales en su plantilla mientras mantenía estándares competitivos.
Sin embargo, su sugerencia de que el Villa no podía igualar la posición del Manchester United en el fútbol resultó particularmente impopular entre los aficionados.
La disculpa llegó mientras el Villa se preparaba para su partido de Premier League contra el Manchester City, con el club dejando claro que no aceptaría lo que consideraba ataques inaceptables a su identidad y a sus aficionados.
Si la disculpa de Carragher será suficiente para dar por cerrado el asunto sigue siendo incierto, ya que el Villa ha anunciado públicamente su intención de emprender acciones legales.