El centrocampista de Ipswich Town dejó la selección nacional tras un enfrentamiento con Córdova, habiendo sido excluido del amistoso contra Estados Unidos. La federación chilena anunció que Núñez había sido liberado por "razones personales".
Según La Tercera, Núñez sentía que su experiencia y estatus como jugador en la Premier League merecían mayor consideración. Su frustración se vio agravada por los comentarios públicos de Córdova sobre jugadores individuales tras las derrotas de Chile.
El informe dice que los jugadores dentro del plantel creen que el entrenador ha ido demasiado lejos al exponer públicamente a los miembros del equipo. En el vestuario, la crítica a individuos en conferencias de prensa puede ser vista como una violación de los códigos establecidos en el fútbol.
Córdova también ha sido criticado por distanciarse de los jugadores tras malos resultados. El entrenador chileno señaló el nivel internacional de generaciones anteriores al explicar las dificultades que enfrenta el actual plantel.
"Cuando Chile estaba en su mejor momento, nuestros mejores jugadores jugaban en los mejores clubes del mundo", dijo Córdova.
Agregó que el plantel necesitaba nuevos líderes y voces dentro del vestuario.
Jean Beausejour desafió ese argumento al señalar al equipo chileno que comenzó la clasificación para la Copa del Mundo 2010. Señaló que aproximadamente el 70 por ciento de ese plantel estaba jugando en Chile en ese momento, mientras que futuras estrellas como Arturo Vidal, Claudio Bravo y Alexis Sánchez aún no se habían establecido en los clubes europeos más grandes.
La disputa, por lo tanto, se ha vuelto más grande que la decisión de Núñez de no jugar contra Estados Unidos. Córdova ya está trabajando como entrenador interino del equipo mayor, mientras que su rol permanente sigue dentro de la estructura juvenil de Chile.
También ha reconocido que daría la bienvenida a Manuel Pellegrini tomando las riendas del equipo mayor en el futuro.
Otro episodio ha añadido presión. Córdova y el gerente de selecciones nacionales Felipe Correa viajaron a Río de Janeiro para intentar persuadir a Erick Pulgar de unirse a Chile para la gira por América del Norte, pero el centrocampista del Flamengo eligió quedarse con su club.
La acumulación de problemas ha dejado a Córdova enfrentando preguntas sobre su autoridad y comunicación en un momento difícil para Chile. La salida de Núñez ha puesto esas preocupaciones en un enfoque más agudo, con la selección nacional aún preparándose para su último partido de la gira contra México.